如果掩埋較淺，很可能被流浪貓狗刨除，對環境造成很大汙染。

這些動物屍體中所攜帶的細小病毒、犬瘟熱等，在正常環境中可存活一年以上，並有傳染能力。還有一些人畜共患的細菌，當掩埋不當被暴露在空氣中時，就會接觸到人，造成傳染。如果附近沒有無害化處理場所，必須進行掩埋的話，也一定要深埋。挖坑的深度要大於一米，並撒上一層生石灰，將動物屍體放入，然後再撒一層生石灰，之後再進行填土掩埋。

如果附近有病死動物處理場所，一定要帶去進行無害化處理，病死動物在無害化處理設備中被高溫高壓處理後，細菌不僅被殺滅，還能得到骨粉和油脂。這種處理方式是目前比較正規的方法。